KPPN Purwokerto mengelola anggaran belanja sebesar Rp6.347.847.879.000,00 pada tahun anggaran 2023 untuk disalurkan kepada 17 Kementerian/Lembaga yang terdiri dari 71 satuan kerja di wilayah Kabupaten Banyumas dan Kabupaten Purbalingga.  Dari total anggaran tersebut terdapat  dana transfer yang di salurkan ke Pemerintah Kabupaten Banyumas dan Pemerintah Kabupaten Purbalingga sebesar Rp3.929.928.949.000,00.

Pagu anggaran untuk Kementerian/ Lembaga sebesar Rp2.417.918.930.000,00 terdiri dari belanja pegawai Rp1.269.081.790.000,00 belanja barang Rp849.433.068.000,00 belanja modal Rp287.103.872.000,00 dan belanja bantuan sosial Rp12.300.200.000,00.

Sampai dengan 31 Maret 2023 realisasi belanja yang disalurkan oleh KPPN Purwokerto sebesar      Rp1.421.641.421.501,00 atau 22,40% dengan rincian sebagai berikut Belanja Pegawai Rp246.276.397.068,00 Belanja Barang Rp116.405.685.866,00 Belanja Modal Rp50.234.532.505,00 Belanja Bantuan Sosial Rp4.692.600.000,00 dan Belanja Transfer Rp1.004.032.206.062,00.