Sumber daya manusia (SDM) adalah salah satu faktor yang sangat penting bahkan tidak dapat dilepaskan dari sebuah organisasi, baik institusi maupun perusahaan. SDM juga merupakan kunci yang menentukan perkembangan suatu organisasi. 

Dalam mendukung pelaksanaan tugas pokok dan fungsi yang ada, KPPN Palopo memiliki 20 pegawai dengan penempatan sesuai dengan kompetensi pada 1 Subbagian Umum dan 4 Seksi Teknis yaitu Seksi Pencairan Dana, Seksi Bank, Seksi Verifikasi dan Akuntansi, dan Seksi Manajemen Satker dan Kepatuhan Internal.