KPPN Bengkulu memiliki Sumber Daya Manusia 25 orang pegawai, yang terdiri dari 12 orang pegawai laki-laki dan 13 orang pegawai perempuan, yang terdiri dari :
- 1 Kepala Kantor
- 1 Pejabat Fungsional
- Subbagian Umum : 1 Kepala Subbagian dan 5 Pelaksana
- Seksi Pencairan Dana : 1 Kepala Seksi dan 6 Pelaksana
- Seksi Bank : 1 Kepala Seksi dan 2 Pelaksana
- Seksi Verifikasi dan Akuntansi : 1 Kepala Seksi dan 3 Pelaksana
- Seksi MSKI : 1 Kepala Seksi dan 2 Pelaksana
