Berdasarkan laporan Nilai Kinerja Organisasi (NKO) KPPN Kudus periode sampai dengan Juni 2025, capaian kinerja secara keseluruhan memperoleh nilai 115,04 yang menunjukkan performa sangat baik. Pada perspektif stakeholder, capaian mencapai 118,08 dengan peningkatan signifikan pada kualitas IKPA K/L dan laporan keuangan Kuasa BUN. Perspektif customer mencatat nilai sempurna 120,00 melalui kepuasan layanan KPPN dan implementasi tugas advisory. Pada perspektif internal process, capaian rata-rata 116,17 yang didukung keberhasilan dalam penyaluran dana transfer, pengelolaan kas, serta penyelesaian SP2D. Sementara itu, perspektif learning and growth memperoleh 106,30 dengan pengelolaan kinerja organisasi, SDM, kepatuhan internal, serta TIK yang tetap terjaga baik. Secara umum, hasil ini mencerminkan efektivitas pengelolaan keuangan negara, pelayanan yang prima, serta pengendalian internal yang kuat di KPPN Kudus.