KPPN Makale dipimpin oleh seorang Kepala Kantor dan didukung oleh sumber daya manusia yang terdiri dari 4 orang pejabat eselon IV, 1 orang pejabat PTPN Terampil, dan 8 orang pelaksana. Dari 8 orang pelaksana, sebanyak 1 orang merupakan lulusan dari program D-1 PKN STAN dan sebanyak 7 orang merupakan lulusan dari program D-3 PKN STAN.


