KPPN Mamuju resmi beroperasi pada 3 April 2006 sebagai tindak lanjut pembentukan Provinsi Sulawesi Barat yang ditetapkan pada tahun 2004. Sebelum berdirinya KPPN Mamuju, seluruh satuan kerja di wilayah Provinsi Sulawesi Barat berada dalam wilayah kerja KPPN Majene. Pembentukan KPPN Mamuju bertujuan mendekatkan layanan perbendaharaan kepada para pemangku kepentingan serta mendukung pengelolaan keuangan negara di Provinsi Sulawesi Barat.
Pada awal operasionalnya, KPPN Mamuju menempati gedung milik Pemerintah Kabupaten Mamuju di Jalan Jenderal Ahmad Yani Nomor 14, Mamuju. Gedung tersebut sebelumnya merupakan Kantor Kesbang dan Linmas Kabupaten Mamuju.
Seiring meningkatnya kebutuhan pelayanan, pemerintah membangun Gedung Keuangan Negara (GKN) Mamuju sebagai pusat layanan vertikal Kementerian Keuangan di Provinsi Sulawesi Barat. Sejak 6 Mei 2013, KPPN Mamuju resmi menempati lantai 2 GKN Mamuju di Jalan Soekarno Hatta. Selanjutnya, KPP Pratama Mamuju dan Kanwil DJPb Provinsi Sulawesi Barat turut menempati gedung yang sama sehingga GKN Mamuju menjadi pusat pelayanan Kementerian Keuangan di Sulawesi Barat.
Pada Januari 2021, gempa bumi yang melanda Sulawesi Barat mengakibatkan kerusakan pada Gedung Keuangan Negara Mamuju sehingga pelayanan sementara dipindahkan ke kantor sementara di Jalan R.E. Martadinata, Simboro, guna menjamin keberlangsungan layanan kepada seluruh satuan kerja.
Setelah proses rehabilitasi dan pembangunan Gedung Keuangan Negara selesai dilaksanakan, mulai tanggal 6 April 2026 KPPN Mamuju kembali memberikan pelayanan di Gedung Keuangan Negara Mamuju. Kembalinya operasional ke GKN menjadi tonggak penting dalam penguatan kualitas layanan, penyediaan sarana prasarana yang lebih representatif, serta peningkatan kenyamanan bagi pengguna layanan.
Saat ini, Kantor Pelayanan Perbendaharaan Negara (KPPN) Tipe A1 Mamuju berkedudukan di Lantai 3 Gedung Keuangan Negara (GKN) Mamuju, Jalan Soekarno Hatta, Karema, Kecamatan Mamuju, Kabupaten Mamuju. Dengan dukungan fasilitas yang semakin memadai, KPPN Mamuju terus berkomitmen memberikan layanan perbendaharaan yang profesional, modern, akuntabel, dan berorientasi pada pelayanan prima guna mendukung pengelolaan keuangan negara di Provinsi Sulawesi Barat.
