Kantor Pelayanan Perbendaharaan Negara Palu merupakan instansi vertikal yang berada dan bertanggung jawab kepada Kepala Kantor Wilayah Direktorat Jenderal Perbendaharaan Provinsi Sulawesi Tengah. Pada awalnya Kantor Pelayanan Perbendaharaan Negara Palu bernama Kantor Bendahara Negara (KBN) yang dibentuk pada tanggal 1 Oktober 1965. Pada 12 Juni 1976 Kantor Bendahara Negara Palu mengalami perubahan dan struktur organisasi dipecah menjadi tiga unit kerja yaitu:
- Kantor Perbendaharaan Negara (KPN),
- Kantor Kas Negara (KKN), dan
- Satuan Kerja Kantor Wilayah Direktorat Jenderal Anggaran yang berada di daerah.
Pada awal mulanya Kantor Pelayanan Perbendaharaan Negara Palu bernama Kantor Bendahara Negara (KBN) yang dibentuk pada tanggal 1 Oktober 1965 dengan 7 (tujuh) pegawai. Pimpinan sementara dijabat oleh Bapak Sahertian sampai dengan tanggal 18 Oktober 1965. Selanjutnya diserahterimakan kepada Bapak Dj. Ratulangi sebagai Kepala Kantor Definitive dengan komposisi pegawai yang terdiri dari:
1) Bapak Dj.Ratulangi sebagai Kepala KBN
2) Bapak Ali Soeman, BA sebagai Kepala Urusan Umum.
3) Bapak Burhan Bachmit sebagai Kepala Urusan Pemeriksaan dan Pembukuan.
4) Bapak Soetanto Moelyatmojo sebagai Kepala Urusan Kas.
5) Bapak J.Marengko sebagai Kepala Urusan Pembiayaan.
Pada tanggal 12 Juni 1976 Kantor Bendahara Negara Palu mengalami perubahan dan struktur organisasi dipecah menjadi tiga unit kerja yaitu Kantor Perbendaharaan Negara (KPN),Kantor Kas Negara (KKN),dan satuan Kerja Kantor Wilayah Direktorat Jenderal Anggaran yang berada di daerah. Tanggal 20 Juni 1976 Kepala KPN Palu di jabat oleh Bapak Sambasudin Usman, BC.KN, alamat kantor terletak di Jalan Pramuka dan KKN Palu di jabat oleh Bapak Drs.Wahyudi serta satuan Kerja Kantor Wilayah Direktorat Jenderal Anggaran Palu yang di jabat oleh Bapak J.U.Tambun.
Pada tanggal 20 Juni 1980 tepatnya hari Sabtu, bangunan Kantor Perbendaharaan Negara Palu yang beralamat di Jalan Tanjung Dako No.11 diresmikan oleh Sekretaris Dirjen Anggaran yaitu Bapak H. Imam Rusdi, dan pada waktu itu Kantor Perbendaharaan Negara Palu di kepalai oleh Bapak Drs. R. Wiyatno.
Berdasarkan Keputusan Menteri Keuangan RI No.645/KMK.01/1990 tanggal 1 April 1990 KKN dan KPN Palu di gabung menjadi Kantor Perbendaharaan dan Kas Negara (KPKN) type C dan Kepala Kantornya di jabat oleh Drs.Nahid Hudaya, MA.
Pada tanggal 1 Juni 1990, KPKN Palu ditingkatkan tipenya menjadi tipe B, kemudian sesuai Keputusan Menteri Keuangan RI No.442/KMK.01/2001 tanggal 23 juli 2001 di tingkatkan kembali menjadi tipe A dan Kepala Kantornya dijabat ole Bapak Drs. M.L. Mamahit.
Berdasarkan keputusan Menteri Keuangan RI No.303/KMK.01/2004 tanggal 23 Juni 2004 tentang perubahan nama Kantor Perbendaharaan dan Kas Negara Palu (KPKN Palu) menjadi Kantor Pelayanan dan Perbendaharaan Negara Palu (KPPN Palu), dan Kepala Kantornya dijabat oleh Bapak Drs.R.Heru Wahyudi.
Seiring dengan bergulirnya reformasi birokrasi di lingkungan Kementerian Keuangan, maka Kantor Pelayanan Perbendaharaan Negara Palu pada Januari 2008 ditetapkan sebagai KPPN Percontohan Tahap II dan sejak saat itu melaksakan Prosedur Standard Operasioanl (SOP) KPPN Percontohan, yaitu memberikan pelayanan prima kepada stakeholders dengan prinsip:
- Pelayanan satu tempat (One Stop Service);
- Bisnis proses yang sederhana;
- Pemanfaatan teknologi secara optimal;
- Memberikan informasi secara real time;
- Cepat, tepat, akurat, transparan, akuntabel dan tanpa biaya.
Adapun nama-nama Kepala Kantor Pelayanan dan Perbendaharaan Negara sejak tanggal 01 Oktober 1965, yaitu:
1. Bapak Th.Dj. Ratulangi 18-10-1965
2. Bapak J.D.Kairupan 21-09-1965
3. Bapak Usman Said 26-04-1968
4. Bapak Drs.Rusmandi 14-06-1972
5. Bapak Sambasudin Usman.BC.KN 17-09-1975
6. Bapak Drs.R.Wiyatno 09-10-1978
7. Bapak Drs.Damrah Siregar 06-10-1982
8. Bapak N.Lobo 07-03-1984
9. Bapak Drs.J.Barisi 09-06-1986
10. Bapak Drs. Nahid Hudayana,MA 17-04-1990
11. Bapak Jean A.E.Rombot 10-04-1992
12. Bapak Mangara T.Siahaan,SE 10-07-1993
13. Bapak Drs.H. Muh.Muhadjir Mukti 27-06-1996
14. Bapak Drs.Zainal Arifin 29-10-1999
15. Bapak Drs.M.L.Mamahit 24-04-2000
16. Bapak Drs.R.Heru Wahyudi,MM 07-01-2002
17. Bapak Nono Sugijono,SH 05-02-2007
18. Bapak Drs.Bani Amin 09-02-2007
19. Bapak Sardjito,S.sos 27 -07-2007
20. Bapak Ahmad Juhari (2007 s.d. 2011)
21. Bapak Istu Wahudi (2011 s.d. 2013)
22. Bapak Slamet Parman (2013 s.d. 2015)
23. Bapak Muhtar Salim (2015 s.d. 2019)
24. Bapak Abdul Yusuf, SST.Ak, MPA Tahun 2019 s.d. sekarang