Kinerja realisasi APBN s.d 29 Februari 2024 dalam wilayah kerja KPPN Kupang masih di dominasi oleh Belanja Pegawai yaitu sebesar Rp436 miliar rupiah atau 19,17% sedangkan untuk komponen Belanja Transfer Ke Daerah tertinggi masih Dana Alokasi Umum yaitu sebesar Rp1,14 triliun rupiah





