KPPN Pematangsiantar telah menyusun formula strategi untuk mencapai tujuan organisasi. Hal ini dituangkan dalam Strategi Organisasi KPPN Pematangsiantar Tahun 2024 yang juga telah disosialisasikan kepada stakeholder. Adapun strategi yang digunakan adalah kombinasi Strength-Threat.
Diharapkan dengan strategi tersebut, KPPN Pematangsiantar dapat memberikan pelayanan terbaik kepada stakeholder serta mewujudkan visi KPPN Pematangsiantar menjadi Pengelola Perbendaharaan Negara di Daerah yang Profesional, Transparan, Modern dan Akuntabel.