Dalam rangka pencapaian Visi dan Misi, KPPN Tolitoli memformulasikan strategi organisasi yang berdasar kepada analisis terhadap faktor-faktor pendukung maupun penghambat yang berasal dari internal maupun eksternal organisasi dengan mempertimbangkan kesesuaian dengan Visi dan Misi Organisasi.
Strategi Organisasi merupakan salah satu guideline pelaksanaan kegiatan dan pengambilan kebijakan selama tahun berjalan serta meningkatkan awareness terhadap potensi dan risiko yang ada demi tercapainya Visi dan Misi Organisasi secara optimal. Untuk dapat merumuskan kebijakan dan program dengan lebih akurat, Strategi Organisasi disusun dengan mempertimbangkan risiko, peluang, kelebihan serta kekurangan dari dalam maupun luar organisasi, maka ditetapkanlah Strategi Organisasi sebagaimana berikut :