Penerapan Shadow Organization pada Kanwil DJPb Provinsi Kalimantan Timur telah ditetapkan melalui Keputusan Kepala Kanwil DJPb Provinsi Kalimantan Timur Nomor KEP-19/WPB.20/2023 tentang Struktur Shadow Organization Kantor Wilayah Direktorat Jenderal Perbendaharaan Provinsi Kalimantan Timur Tahun 2023 dan diperbarui dengan Keputusan Kepala Kanwil DJPb Provinsi Kalimantan Timur Nomor KEP-62/WPB.20/2023 tentang Perubahan atas Keputusan Kepala Kantor Wilayah Direktorat Jenderal Perbendaharaan Provinsi Kalimantan Timur Nomor KEP-19/WPB.20/2023