Sebagai organisasi modern, terdapat keterkaitan yang sangat kuat antara pelaksanaan tugas dan fungsi KPPN Bitung dengan instansi lainnya. Salah satu contoh konkrit keterkaitan tersebut misalnya pada Implementasi Kartu Kredit Pemerintah, pihak-pihak yang terlibat secara aktif dalam implementasi KKP adalah Satuan Kerja, KPPN, dan Bank Penerbit KKP. Demikian pula halnya dalam hal yang lain, terdapat keterkaitan yang erat dengan instansi lainnya, seperti KPP Pratama, BPJS Kesehatan, dan Pemerintah Daerah.
