Dalam rangka persiapan masa transisi PSBB menuju tatanan new normal, pada lingkungan KPPN Jakarta II telah dipasang beberapa sarana pencegahan penyebaran Covid 19 seperti tempat pengecekan suhu tubuh pada pintu masuk beserta hand sanitizer, dan bilik disinfektan yang diinstalasikan pada tempat yang sering dilalui pegawai. Beberapa di antaranya merupakan partisipasi dari sejumlah satker mitra kerja KPPN Jakarta II, misalnya bilik disinfektan dari Kementerian Pertahanan.

Sarana tersebut menjadi bentuk fasilitas kepada pegawai dan satker mitra kerja KPPN Jakarta II agar tetap memperhatikan protokol kesehatan dalam melaksanakan tugas layanan perbendaharaan di lingkungan KPPN Jakarta II.